发生医疗纠纷的处理方式有：
一、协商。医患双方就赔偿问题进行协商，达成一致意见，双方签订协议书，可以办理公证或律师见证，并报卫生行政主管部门备案。
二、调解（在第三方，如人民调解委员会的支持下协商解决）、仲裁（在双方同意仲裁的情况下）。
三、申请卫生行政部门处理。当事人可以向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请，知道或者应当知道其身体健康受到损害之日起1年内提出。
四、向人民法院起诉。当事人知道或者应当知道权利受到损害三年内向人民法院请求保护民事权利。