【法律分析】
劳动合同期限与服务期协议约定期限不一致的，需要区分不同的情况来处理：
（一）劳动合同期限长于服务期期限的
如果劳动合同期限长于服务期期限，服务期期限届满后，双方可以继续按照劳动合同约定期限履行，但此后劳动者提出辞职的，无需支付违约金。

（二）服务期期限长于劳动合同期限的
当劳动合同期限届满，服务期尚未届满时，如果双方没有特别约定，劳动者和用人单位任何一方都不得随意终止合同，劳动合同应当续延至服务期满，也就是说，如果双方没有特别约定，当劳动者培训归来不符合用人单位用工需求时，用人单位放弃服务期约定的权利将受到限制。

【实务操作】
建议用人单位在服务期协议中明确约定服务期与劳动合同期限发生冲突的处理，约定内容可以参考：“服务期长于劳动合同期限时，劳动合同期限自动延长至服务期期限届满。但是公司有权选择放弃服务期利益，可以在劳动合同到期时与员工终止劳动合同。”